Kort sagt
Når man ser på den genetiske kode, ser det ud til, at mest redundans er på det tredje bogstav snarere end på det første eller andet bogstav i kodonen. Hvorfor har det udviklet sig på denne måde?
Længere version
For at sammenligne den relative redundans, som hver bogstav i kodonen, lad os antage, at hvert kodon forekommer med samme frekvens. Det er sandsynligvis forkert, men nyttigt af hensyn til beregningerne. Brug af observerede frekvenser af kodonbrug i en given population ville ændre følgende sandsynligheder, men spørgsmålet om, hvorfor nogle positioner i codon har mere redundans end nogle andre stadig har.
En erstatning af kodonets første bogstav har en sandsynlighed for at $ \ frac {1} {2048} ≈0.00005 $ (Stop codon) er synonymt. En erstatning af kodonets andet bogstav har sandsynligheden $ \ frac {3} {256} ≈0.012 $ (nukleobaser U og G) for at være synonym. En erstatning af det tredje bogstav har sandsynligheden for, at nøjagtigt $ \ frac {2} {3} $ er synonymt.
Sandsynligheden for, at en erstatning er synonym, da det skete på ...
- Første bogstav: $ \ frac {1} {2048} ≈0.00005 $
- Andet bogstav: $ \ frac {3} {256} ≈0.012 $
- Tredje bogstav: $ \ frac {2} {3} $
Hvorfor er der mere redundans på den tredje position end på den anden (som har mere redundans end den første position) i kodonen?