Jeg er næppe en autoritet om dette emne, men jeg husker tydeligt en fantastisk rapport i midten af 1990'erne af co-krystalstrukturen, det gær TATA-bindende protein i kompleks med DNA. Strukturen viser, at TBP bøjer DNA-aksen med ca. 80 grader, sandsynligvis for at eksponere baser og forbedre genkendelse. Strukturen er tilgængelig på RCSB: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=1ytb. (Sørg for at tjekke Jmol-visningen.)
Termodynamisk set ville bøjning af DNA kræve energi. Derfor ville DNA, der var forbøjet (fx på grund af hjælpebindende proteiner eller sammensætningsforstyrrelse) forbedre bindingen.
Så jeg formoder, at i den sammenhæng, DNA-bindende proteiner, "buet" henviser til den statiske krumning af ubundet DNA eller til bøjning af DNA ved binding for at lette genkendelse.