Jeg har aldrig hørt om udtrykket før i dag, men en hurtig søgning indebærer, at visse DNA-sekvenser er mere bøjelige end andre. Mest bemærkelsesværdigt er Widom-sekvensen, der binder til histoner. Det bemærkes også, at DNA ikke er en frit flydende polymer, men at der også er en vis retning i dens bøjning. Det ser ud til, at konceptet bedst udforskes i denne anmeldelse: Buet DNA.

det er ikke nødvendigvis cirkulært - transkriptionsfaktorerne kræver normalt en krumning, der er meget større end hvad et plasmid vil have, og kravet kan også vises på eukaryote proteiner. DNA-bindende proteiner vil forårsage en lokal sløjfe eller krumning, der passer til transkriptionsfaktoren.

Det klassiske billede er for Gal og Lac-repressorproteiner, der binder 2 tråde samtidigt og forårsager en sløjfe i DNA'et.

Reference: se fig. 1 i: http: //genesdev.cshlp.org/content/3/5/606.full.pdf+html

Jeg er næppe en autoritet om dette emne, men jeg husker tydeligt en fantastisk rapport i midten af ​​1990'erne af co-krystalstrukturen, det gær TATA-bindende protein i kompleks med DNA. Strukturen viser, at TBP bøjer DNA-aksen med ca. 80 grader, sandsynligvis for at eksponere baser og forbedre genkendelse. Strukturen er tilgængelig på RCSB: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=1ytb. (Sørg for at tjekke Jmol-visningen.)

Termodynamisk set ville bøjning af DNA kræve energi. Derfor ville DNA, der var forbøjet (fx på grund af hjælpebindende proteiner eller sammensætningsforstyrrelse) forbedre bindingen.

Så jeg formoder, at i den sammenhæng, DNA-bindende proteiner, "buet" henviser til den statiske krumning af ubundet DNA eller til bøjning af DNA ved binding for at lette genkendelse.